沛納海P5000機芯展現了非凡的精密工藝。這款機芯直徑達到15¾法分（35.7毫米），厚度僅為4.5毫米，由127個精細零件構成，其中包含21顆寶石軸承。它的平衡擺輪振頻設定為3赫茲，每小時振動高達21,600次，確保了時間的精確性。

P.5000機芯的設計獨特，它沿用了傳統機芯的上下兩層夾板保護大部分齒輪的構造，只有擺輪夾板和撥針輪等少數組件裸露在外，這樣的設計使得機芯更加堅固可靠。

值得一提的是，P.5000機芯內置了變量慣性擺輪，通過調節擺輪外部的調時螺釘，可以靈活調整振動間距。這一創新設計使得平衡游絲無需安裝限位銷來調節振動有效長度，進一步提升了機芯的精準度。

平衡擺輪的夾板由兩顆螺絲固定在下方，通過兩組螺紋圈的雙向轉動，可以輕松調節擺輪的擺動軸心幅度。這種技術不僅增強了機芯的抗沖擊能力，還保證了擒縱機構在遭受沖擊時仍能維持精準運行。

此外，P.5000機芯配備了兩個游絲發條盒和連續齒輪，為機芯提供了長達8日（共192小時）的動力儲存。雙發條盒系統采用纖細而幼長的游絲，不僅延長了動力儲存時間，還保證了動力輸出的穩定性，讓機芯始終保持在最佳狀態。